组织结构已和古代大明的“都察院”大不一样。
现在都察院最高长官有两个，左右都御史。下面是两个副左右都御史。下往下，是佥都御史。佥都御史就相当于“职称”了，分管具体部门的长官除具体官职外，都会被授予“佥都御史”衔。再往下就是监察御史了。监察御史也就是普通御史了，都察院里的大部分人员，除各自职务外，都被授予“监察御史”衔。
自左右都御史以下，设若干“司”，分管不同的职能，司长官就是佥都御史。
明朝古代的都察院，职能主要是弹劾、监察，除“巡按”外很少直接执法。但现在的都察院就是一个集调查、搜查、拘捕、扣留、审讯等权力于一身的执法机构，管得非常宽，上至皇亲国戚、辅、内阁大臣，下至各级军政官员、大小公职人员，所有涉及贪腐舞弊、利用职权犯罪的案件，都察院都可以直接介入调查。
在如今的大明，都察院可以说是权力最大、也是最独立的部门。东厂是直接向辅大臣负责的，而都察院则直接对皇帝负责。从这一点上说，都察院权力大过于所有政府机构，甚至人民卫队。人民卫队虽然也只对皇帝负责，但毕竟不能去查都察院，而都察院却可以来查人民卫队。
如果都察院认为情况紧急，可以不请示皇帝而直接对任何官员、任何地方进行搜查，事后再向皇帝和法院法官提交报告，解释必要性。
向小强在看到这儿的时候，本能地有了一个疑问：都察院权力这么大，谁来监督都察院？
但他很快就看到，都察院只是一个执法机构，并不是检控机构，更不是判决机构。它权力虽大，但只管调查、收集证据，调查完了移交检察院，告不告、提不提出公诉都是检察院的责任。当然，大明检察院也只有审查批准逮捕、决定起诉并出庭支持公诉的权力。至于是否有罪、怎么判，那就是法院的事了。
也就是说，大明的“三大院”，都察院、检察院、法院，分别掌管单独的环节，防止权力集中，一手遮天。当然，假如检察院和法院有问题，都察院也照查不误。
肚子疼提醒向小强，要多多注意都察院的保密司。都察院专门调查涉密单位的部门，就叫保密司。凡是可能涉及机密的地方，比如东厂、锦衣卫、军队、包括人民卫队，都由保密司来调查。
“保密司这帮家伙，什么地方都能搜，什么文件都能看。”
肚子疼恨恨地说。
也就是说，今天来的这帮御史，都是保密司的。
……
都察院保密司这次几乎倾巢出动，五十多